De stad Bongor is gelegen aan de oostelijke oever van de rivier Logone. Tijdens het regenseizoen, die duurt van mei tot september, is deze rivier bevaarbaar tussen Bongor en N'Djamena, de hoofdstad van Tsjaad. De stad heeft een levendig centraal gelegen marktplein, een vliegveld, een postkantoor en een ziekenhuis. Katoen en rijst zijn de belangrijkste marktgewassen van de regio. Aan de oever van de Logone ligt een hotel.