De Taiwanese makaak is een bosbewoner, die zowel op de grond als in de bomen leeft. Vroeger kwam de Taiwanese makaak waarschijnlijk voornamelijk langs de zeekust voor, waar hij zelfs op de zeekliffen klom. Door menselijke activiteiten is hij echter grotendeels verjaagd naar afgelegen heuvelachtige streken in het binnenland. Daar leeft hij nu in bossen, meestal op een hoogte van 600 tot 800 meter. Een enkele keer kunnen ze tot op 3000 meter hoogte aangetrofen worden.