De waterjuffer heeft net als libel een langwerpig lichaam en vier vleugels.
De juffer is echter veel slanker en tengerder gebouwd dan de echte libellen, bij deze laatste zijn de vier vleugels even groot waardoor ze zeer goed en snel kunnen vliegen.
De waterjuffers hebben vleugels waarbij de voor- en achtervleugels ongelijk van vorm zijn en minder stevig, waardoor de juffer langzamer en minder wendbaar is tijdens het vliegen.